Manfred Flügge est né à Kolding (Danemark). Ses parents sont originaires de Königsberg (Prusse Orientale). Il a passé son enfance dans la Ruhr et a fait des études à Munster (Westphalie) et à Lille. Après avoir enseigné pendant deux ans au Goethe Institut de Lille et pendant douze ans à l'université Libre de Berlin-Ouest (littérature et civilisation françaises), il s'est mis à vivre de sa plume à partir de 1988. Il a publié des biographies, des romans, des essais et des contes radiophoniques pour enfants. Depuis peu, il écrit pour le théâtrea. Il a collaboré à des films documentaires (dont Le diplomate sur Stéphane Hessel - en 1995).
Il est aussi traducteur et critique littéraire et, de temps en temps, au Magazine littéraire. Ses livres sont traduits en français, en italien et en japonais. Manfred Flügge vit à Berlin depuis 1976, mais il fait de longs séjour en France comme aux États-Unis. Depuis 2004, sa résidence principale est à Saint-Maurice, dans la banlieue parisienne.